Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Pggt1bQ8BUY9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pggt1bQ8BUY9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pggt1bQ8BUY9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pggt1bQ8BUY9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pggt1bQ8BUY9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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