Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Nop53Q8BK35 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nop53Q8BK35 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nop53Q8BK35 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Nop53Q8BK35 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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