Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp1Q8BJQ2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Usp1Q8BJQ2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usp1Q8BJQ2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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