Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Amigo1Q80ZD8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Amigo1Q80ZD8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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