Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
NanogQ80Z64 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms