Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccp110Q7TSH4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccp110Q7TSH4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms