Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms