Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trak1Q6PD31 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trak1Q6PD31 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms