Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Slf2Q6P9P0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms