Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trak2Q6P9N8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms