Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sp140Q6NSQ5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sp140Q6NSQ5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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