Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CltbQ6IRU5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms