Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Krt77Q6IFZ6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms