Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sh3rf1Q69ZI1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sh3rf1Q69ZI1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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