Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg9aQ68FE2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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