Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms