Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

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Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn9aQ62205 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Scn9aQ62205 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn9aQ62205 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn9aQ62205 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scn9aQ62205 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scn9aQ62205 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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