Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rbm38Q62176 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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