Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sin3bQ62141 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sin3bQ62141 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms