Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Lrrn1Q61809 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Lrrn1Q61809 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Lrrn1Q61809 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Lrrn1Q61809 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Lrrn1Q61809 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms