Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Msi1Q61474 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Msi1Q61474 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms