Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms