Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nell2Q61220 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nell2Q61220 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nell2Q61220 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms