Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TmpoQ61033 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TmpoQ61033 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms