Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik1Q60934 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Grik1Q60934 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Grik1Q60934 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik1Q60934 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Grik1Q60934 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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