Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim38Q5SZ99 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms