Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Sft2d1Q5SSN7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sft2d1Q5SSN7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms