Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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