Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Spag9Q58A65 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spag9Q58A65 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spag9Q58A65 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag9Q58A65 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag9Q58A65 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag9Q58A65 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag9Q58A65 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spag9Q58A65 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms