Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Fam220aQ3ZN08 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Fam220aQ3ZN08 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms