Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm28047Q3US59 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28047Q3US59 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm28047Q3US59 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28047Q3US59 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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