Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Acsf3Q3URE1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Acsf3Q3URE1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Acsf3Q3URE1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Acsf3Q3URE1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Acsf3Q3URE1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms