Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SbsponQ3UPR9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SbsponQ3UPR9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms