Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
D13Ertd608eQ3UPR8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms