Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

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Length 985 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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