Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp19Q3UJD6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp19Q3UJD6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms