Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trafd1Q3UDK1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trafd1Q3UDK1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms