Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hace1Q3U0D9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms