Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm21440Q3TTD8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21440Q3TTD8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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