Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc13Q3TIR1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms