Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Prr27Q3SYJ2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms