Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms