Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rundc1Q0VDN7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rundc1Q0VDN7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms