Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tigd2Q0VBL1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms