Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rab42Q0PD08 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms