Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrriq1Q0P5X1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrriq1Q0P5X1 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms