Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Neurl1bQ0MW30 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms