Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubxn2bQ0KL01 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms