Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Tff1Q08423 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tff1Q08423 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tff1Q08423 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tff1Q08423 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tff1Q08423 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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