Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl7Q03366 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl7Q03366 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms